Gemäß kirchlichem Statut als Pia Unio ist folgende Leitungshierarchie für den Lazarus-Orden festgelegt:
DER GROSSPRIOR
Der Großprior ist der höchste Oberer des Lazarus-Ordens im Großpriorat von Österreich. Er vertritt diesen rechtswirksam nach außen. Ihm obliegt die oberste Leitung des Großpriorats. Der Großprior wird durch Seine Eminenz, den Kardinal und Erzbischof von Wien, auf Ersuchen des Kapitels aus den Reihen der Ordensritter ernannt.
DER STATTHALTER
Der Statthalter hat die ausführende Leitung des Lazarus-Ordens im Großpriorat von Österreich inne. Bei Vakanz oder Verhinderung des Großpriors nimmt er die Agenden desselben als Oberer wahr. Die Bestellung des Statthalters erfolgt durch Wahl auf dem Generalkapitel aus den Reihen der Ordensritter und bedarf der Bestätigung durch Seine Eminenz, den Kardinal und Erzbischof von Wien.
DER ORDENSPRÄLAT
Der Ordensprälat ist für spirituelle, kirchliche und seelsorgliche Angelegenheiten des Lazarus-Ordens im Großpriorat von Österreich zuständig. Er steht dem Ordensklerus vor. Der Ordensprälat wird durch Seine Eminenz, den Kardinal und Erzbischof von Wien, auf Ersuchen des Kapitels aus den Reihen der Ordenskleriker ernannt, die im Range eines Bischofs, Abtes oder emeritierten Abtes stehen.
DAS KAPITEL
Das Kapitel unterstützt den Großprior als Ratsversammlung in den Entscheidungen der Amtsführung des Lazarus-Ordens im Großpriorat von Österreich. Es berät diesen und beschließt in allen Angelegenheiten des Ordens. Dem Kapitel gehören der Großprior, der Statthalter, der Ordensprälat und Kapitulare an, die aus den Reihen der Ordensritter bestellt sind.
DER ORDENSRAT
Der Ordensrat ist ein konsultatives Kollegium, das dem Großprior und dem Statthalter in fachlichen Fragen beratend zur Seite steht. Der Großprior, in seiner Vertretung der Statthalter, kann einzelne Ordensritter und Ordenskapläne in den Ordensrat berufen.
DAS GENERALKAPITEL
Das Generalkapitel ist die höchste beschlussfassende Versammlung des Lazarus-Ordens im Großpriorat von Österreich. Das Generalkapitel tritt einmal jährlich zusammen.